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导师信息
姓名: 李恒德 英文名:
 
导师类别: 硕导 所在专业: 动物遗传育种
性别: 最高学位: 博士
所在单位: 中国水产科学研究院
入职年月: 2017-04-08 出生年月: 1976-02-24
职务: 职称: 研究员
研究方向: 统计遗传学与育种 E-Mail: hengde.li@cafs.ac.cn
通讯地址: 北京市丰台区青塔西路150号
简历:

李恒德,男,博士,1976年生,中国水产科学研究院生物技术研究中心研究员。

主要研究方向:

1)统计遗传学与水产育种

    统计遗传学是生物统计学与遗传学相互交叉的学科,是用统计学的方法来研究遗传学的问题。我们主要研究全基因组关联分析(GWAS)、全基因组选择(GS)和选配(GM)的方法。GWAS是基因组时代更为准确高效地研究经济性状遗传基础的方法,GS是利用高通量标记进行个体育种值估计,GM是利用遗传标记进行选配方案设计,以期控制群体近交增量,获得最大的遗传进展。

2)半滑舌鳎性逆转遗传机制解析

    半滑舌鳎是我国特有的土著海水鱼,肉质鲜美,其生物学特点是雌大雄小,雌性成体约为雄性的2-4倍,养殖雌鱼是广大养殖户的渴求,但遗憾的是半滑舌鳎存在雌性向雄性逆转的现象,生产中雌性比例很低,目前的大致水平是20%,严重困扰着半滑舌鳎养殖业的发展。我们采用基因组学和统计学的方法,研究性逆转是如何发生的,是哪些基因控制的,通路是什么,和环境有什么样互作,如何提高生产中雌性比例等问题。

教育经历:

1993.09-1997.07,山西农业大学动物科技学院,动物营养与饲料加工,学士;

1997.09-2000.07,山西农业大学动物科技学院,动物遗传育种与 繁殖,硕士;

2004.09-2008.07,中国农业科学院,动物遗传育种与繁殖,博士;

2006.10-2008.01,丹麦奥胡斯大学,统计遗传学,访问学者。

工作经历:

2000.07-2002.09,长江大学动物科学学院,助教。

2002.10-2004.08,长江大学动物科学学院,讲师。

2008.07-2009.12,中国水产科学研究院,助研。

2010.01-2016.12,中国水产科学研究院,副研究员。

2017.01-           ,中国水产科学研究院,研究员。

研究成果:

一、统计遗传学

1)提出了QTL置信区间快速算法,解决了现有方法准而不快,快而不准,而且缺少普适性的问题,(Li, 2011,J Genet)。

2)提出了将QTL信息与GBLUP相结合的育种值估计方法LASSO_GBLUP,(Li et al, 2015, Genetica)。

3)提出了稳定准确的StepLMM方法,将GWAS和GS统一起来,一步完成,既提高了GWAS的精确性,也提高了GS的准确性。

4)开发了一系列具有完全自主知识产权的基因组选择软件。

二、育种实践

1)通过全基因组关联分析发现了控制半滑舌鳎性逆转的关键遗传位点,该位点解释表型变异的83%,其作用类似开关,通过对亲本进行筛选,设计特定亲本组合,可以生产不逆转的半滑舌鳎,将雌性率由目前生产中的20%提高至50%,并一直保持下去。(Jiang and Li, 2017, G3: Genes, Genomes, Genetics).

2)发现了半滑舌鳎性逆转的遗传互作机制。

获奖情况:

“基因组选择育种系统开发”,中国水产科学研究院科技进步奖二等奖,2015,第一完成人。

“扇贝分子育种技术创建与新品种培育”,山东省科技发明一等奖,2016,第四完成人。

“扇贝分子育种体系的建立与应用”,教育部科技发明一等奖,2016,第四完成人。

专利著作:

软件:

1) gsbay:基于bayes方法的基因组选择软件,登记号:2012SR044220。

2) sky:利用分子标记计算关系矩阵的软件, 登记号:2013SR049813。

3) LASSO_GBLUP:基于区分主效基因和微效基因的基因组选择软件,登记号:2014SR013876。

4) QuickCI:QTL置信区间快速计算软件,登记号:2015SR070671。

5) gsim:基因组选择模拟软件,登记号:2015SR070443。

6) StepLMM:线性混合模型逐步回归软件,登记号:2016SR260883。

7) 二项性状混合模型逐步回归软件, 登记号:2016SR324259。

 

 

论文发表:

H. D. Li, M. S. Lund, O. F. Christensen, V. R. Gregersen, P. Henckel, C. Bendixen. Quantitative trait loci analysis of swine meat quality traits. Journal of Animal Science. 2010. 88(9):2904-2912.

H. D. Li*. A quick method to calculate QTL confidence interval. Journal of Genetics. 2011. 90(2): 355-360.

H. D. Li*, J. W. Wang, Z. M. Bao. A novel genomic selection method combining GBLUP and LASSO. Genetica. 2015. 143(3):299–304.

L. Jiang, H. D. Li*. Single Locus Maintains Large Variation of Sex Reversal in Half-Smooth Tongue Sole (Cynoglossus semilaevis). G3: Genes, Genomes, Genetics. 2017. 2017, 7(2):583-589.